Caratterizzazione dei laghi: analisi chimiche, profilo  di parametri fisici sulla colonna d'acqua mediante polisonda, fitoplancton,  zooplancton, benton profondo e litorale, macrofite acquatiche, pesci.

Caratterizzazione  delle acque correnti: habitat fisico (applicazione IFF,  Indice di Funzionalità Fluviale), analisi chimiche, periphyton, micro- e macro-benton,  pesci.

Analisi biologica  della qualità delle acque: IBE (Indice Biotico Esteso) e altri indici di qualità. 

Applicazione  protocolli USEPA.

Ecotossicologia  acquatica.

Piani di gestione  degli ambienti acquatici.

Laghi alpini: studi  limnologici e interventi di risanamento dall'acidificazione mediante liming.

Banche dati e  software ambientali.